Fakulta financí a účetnictví dnešní podoby vznikla 1. července 1991 v rámci organizačních změn celé Vysoké školy ekonomické v Praze. Páteř fakulty byla vytvořena na dvou do té doby působících kateder: katedry financí a úvěru a katedry účetnictví, součástí se stala i katedra pedagogiky. V současné době fakultu tvoří sedm kateder – bankovnictví a pojišťovnictví, didaktiky ekonomických předmětů, financí a oceňování podniku, finančního účetnictví a auditingu, měnové teorie a politiky, manažerského účetnictví, veřejných financí. V čele fakulty stojí děkan, jeho nejbližšími spolupracovníky jsou tři proděkani (pro vědu, výzkum a doktorské studium, studijní a pedagogickou činnost, zahraniční styky), poradkyně děkana a tajemnice fakulty. Výkonným a správním útvarem, který zabezpečuje hospodářskou a administrativní činnost Fakulty je děkanát, který tvoří sekretariát děkana a studijní referentky. Organizační strukturu fakulty ukazuje organizační schéma. Základním posláním fakulty je poskytovat univerzitní vzdělání v akreditovaných studijních programech, vyvíjet vědecko-výzkumnou činnost a provádět habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem v akreditovaných oborech. Fakulta v rámci zabezpečování svého poslání rozvíjí spolupráci s jinými univerzitami, státními institucemi, podnikatelskými a dalšími subjekty na národní i mezinárodní úrovni. Fakulta rozvíjí i další činnosti, jako jsou celoživotní vzdělávání, nebo doplňková činnost.